Publiée au Journal officiel du 28 décembre 2008, la loi de finances pour 2009 ne révise que très modestement le dispositif du Crédit d’Impôt Recherche (CIR). En effet, elle apporte quelques modifications au texte de l’article 244 quater B du Code général des impôts au titre duquel les entreprises peuvent bénéficier du CIR calculé à partir des dépenses de recherche qu’elles ont exposées. Aux termes de cet article, les travaux correspondants peuvent être soit réalisés au sein même de l'entreprise, soit confiés à des organismes de recherche publics ou privés préalablement agréés par le ministère de la recherche.

Désormais, les opérations de sous-traitance peuvent également être confiées à des « fondations reconnues d'utilité publique du secteur de la recherche » et à des « établissements d'enseignement supérieur délivrant un diplôme conférant un grade de master, des fondations de coopération scientifique et des établissements publics de coopération scientifique », formulation plus large que le texte précédent qui visait seulement les « universités ».

D’autre part, la loi de finances prévoit la remise par le Gouvernement d’un rapport d'évaluation sur le CIR au Parlement avant le 30 novembre 2009.
 
L. fin. n° 2008-1425, 27 déc. 2008, JO 28 déc., art. 27, 101 et 102.